Falls du ein Android Smartphone hast und nur kurz was nachschlagen möchtest, könntest du mal die kostenfreie App Kanji Yomi ausprobieren:
http://www.androlib.com/android.application.jp-ne-biglobe-inda3-kanjiyomi-qAjw.aspx
Von den kommerziellen Lösungen würden sich die interne OCR von Adobe Acrobat 9 und Readiris Pro Asian anbieten. Letztere hat den Vorteil, dass man den erkannten Text noch manuell nachkorrigieren kann, was in Acrobat leider nicht so ohne weiteres möglich ist.
Wenn du wirklich, wirklich fit in Japanisch bist und viel mit japanischen Texten arbeitest, würden sich die Suites "
DocuWorks" und "Yonde!!Koko" empfehlen. Insbesondere letztgenannte Software steht im Ruf, einer der besten, wenn nicht sogar DIE beste japanische Texterkennung zu sein. Jedenfalls schwören alle drauf, die viel japanische Texte digitalisieren.