Wie bereits erwähnt, spielt der Film zwei Jahre später und der Mond beginnt auf die Erde herabzustürzen. Da der Mond jetzt zu einem Meteoriten wurde, muss Naruto etwas unternehmen. Währenddessen taucht auch noch ein mysteriöser Mann auf, Toneri Ōtsutsuki, ein verwander und direkter Nachkomme von Kaguya. (Man vermutet er kommt vom SO6P Bruder)
Dieser wollte in Konoha Hinata entführen, schaffte es nicht und nahm stattdessen ihre kleine Schwester, Hanabi Hyuga, mit. Die Helden Naruto, Hinata, Sakura, Sai und Shikamaru werden damit beauftragt, sie zu retten. Dabei gelingt es Toneri auch noch Hinata zu fangen und so muss Naruto beide retten.
Da kann man nur hoffen, dass die beiden am Ende doch zusammen kommen. Happy Ente, wäre doch was!