Es ist impliziert durch 2 Szenen dass Isshin seine Kräfte verloren hat.
1. Arracar Arc
Das erste auftauchen von Isshin als Shinigami. Urahara fragt ihn wie es ist nach 20 Jahren wieder ein Shinigami zu sein. Und Isshin antwortet, dass er nun den Tod seiner Frau gerächt hat, den er nicht verhindern konnte
2. Kurz vorm Ende , als Ichigo gegen Zangetsu kämpf.
Isshin redet mit sich selbst, dass Engetsu damals sich genauso gewährt hat ihm das Finale Getsuga Tensho beizubringen.
Für mich ist daher erwisen, dass Ishin das Finale Getsuga mal angewendet haben muss und daraufhin keine Shinigamikräfte mehr hatte.
Sicherlich Isshin ist nun keine Hauptfigur oder sehr wichtige Nebenfigur, es wäre trotzdem schön, das Universum ein wenig mehr erklärt zu bekommen, z.B. Woher sich Isshin und Ryuken (Ishida´s Vater) kennen, sicher beide sind Ärzte aber Ryuken wusste das Isshin ein Shinigami ist